More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0208 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  99.8 
 
 
510 aa  1018    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  87.62 
 
 
513 aa  920    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  100 
 
 
510 aa  1022    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  87.06 
 
 
510 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  65.02 
 
 
516 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  100 
 
 
510 aa  1022    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  63 
 
 
474 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  48.96 
 
 
527 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 
504 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
483 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
467 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 
484 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 
464 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 
485 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 
516 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 
497 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 
495 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  36.71 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 
479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 
479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 
485 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 
488 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 
496 aa  228  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 
491 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  34.17 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 
485 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 
490 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  32.83 
 
 
486 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 
485 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  28.6 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  30.75 
 
 
509 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 
492 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  35.61 
 
 
483 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 
510 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 
486 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 
502 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 
504 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  32.11 
 
 
461 aa  136  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 
507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 
507 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
511 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
502 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 
475 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
492 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 
492 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 
492 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
501 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
490 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
506 aa  94.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 
491 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.06 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 
454 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 
486 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
459 aa  87.8  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 
495 aa  86.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  29.71 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.43 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 
450 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  26.55 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.94 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.23 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.51 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  27 
 
 
506 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 
487 aa  77  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  25.16 
 
 
553 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.33 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.97 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.41 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.35 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
462 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.75 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  21.11 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>