More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0197 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.47 
 
 
262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.83 
 
 
269 aa  351  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.05 
 
 
259 aa  348  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
260 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
261 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
261 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  46.3 
 
 
275 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
260 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
258 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
257 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
286 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
291 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
271 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
271 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
264 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
263 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
263 aa  175  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.73 
 
 
259 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
272 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.55 
 
 
257 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
256 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
269 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
257 aa  165  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.55 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  38.52 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
262 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
262 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
277 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
260 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
263 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  37.7 
 
 
259 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
344 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
360 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  35.29 
 
 
258 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
267 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
253 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
266 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
267 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
267 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  40.78 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 
266 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
255 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
284 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.34 
 
 
258 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.87 
 
 
267 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
258 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
263 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  39.92 
 
 
268 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
343 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
259 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
265 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
256 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
273 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
258 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
255 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
292 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
266 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  39.22 
 
 
264 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
260 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
258 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
262 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.03 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
258 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
276 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
260 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
268 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
268 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 
256 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
266 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
267 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  37.05 
 
 
266 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 
259 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>