More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0090 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  100 
 
 		 325 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  99.38 
 
 		 325 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  70.68 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  68.31 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  56.78 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  54.09 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  52.83 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  50.9 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  57.47 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  51.21 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  51.9 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  45.68 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  45.78 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  43.95 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  47.74 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  47.02 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  43.43 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  43.08 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  41.96 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  40.24 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  40.84 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.1 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.47 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  34.95 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.66 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.22 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  40.65 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.63 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  40.65 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  27.67 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  34.3 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  29.55 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  34.59 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.33 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  41.01 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  36.01 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  32.25 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.63 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.63 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  32.25 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  32.25 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  31.92 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  31.92 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  32.25 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  31.92 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  31.92 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  29.81 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  28.2 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.1 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  28.2 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.63 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.24 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.63 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.71 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  36.1 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>