77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0070 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  77.32 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  73.1 
 
 
380 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  69.01 
 
 
532 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  56.69 
 
 
390 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  36.18 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  39.66 
 
 
418 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  37.01 
 
 
495 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  36.96 
 
 
364 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  37.11 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  37.11 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  35.71 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  37.34 
 
 
698 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  36.07 
 
 
639 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  35.6 
 
 
665 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  35.34 
 
 
478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  35.44 
 
 
899 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  37.32 
 
 
771 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  35.85 
 
 
362 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  36.64 
 
 
343 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  35.03 
 
 
587 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  34.98 
 
 
405 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  33.01 
 
 
414 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  38.11 
 
 
759 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  36.33 
 
 
619 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.01 
 
 
552 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  35.85 
 
 
346 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  36.14 
 
 
666 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  33.12 
 
 
425 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  33.68 
 
 
475 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  33.68 
 
 
475 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  33.68 
 
 
475 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.11 
 
 
412 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  26.77 
 
 
416 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.21 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  36.94 
 
 
544 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  28.9 
 
 
534 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.74 
 
 
811 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  28.04 
 
 
968 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  28.33 
 
 
1160 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  26.26 
 
 
617 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  27.24 
 
 
926 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  25.94 
 
 
1132 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.8 
 
 
579 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  26.53 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  27.45 
 
 
1519 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  30.63 
 
 
487 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  30.43 
 
 
474 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  27.24 
 
 
533 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  27.24 
 
 
586 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.32 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.47 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  26.02 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  25.15 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0481  septum site-determining protein MinD  25.58 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.747838  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
412 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.9 
 
 
397 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.6 
 
 
542 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.84 
 
 
494 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  27.49 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.39 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  25.93 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  25.93 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.06 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  26.09 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.73 
 
 
478 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  25.68 
 
 
485 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  24.54 
 
 
273 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  24.89 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  24.89 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>