More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0010 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  89.65 
 
 
398 aa  693  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  88.89 
 
 
398 aa  682  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
398 aa  775  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  99.75 
 
 
398 aa  773  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
398 aa  775  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  78.86 
 
 
402 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  69.57 
 
 
396 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  67.35 
 
 
388 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  58.16 
 
 
378 aa  416  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  59.8 
 
 
379 aa  406  1e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.51098e-09  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.73 
 
 
386 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.05 
 
 
408 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  53.11 
 
 
379 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.81 
 
 
375 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  6.84448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.49 
 
 
408 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.93 
 
 
378 aa  362  7e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.03 
 
 
380 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  1.43991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.27 
 
 
396 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.77 
 
 
379 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.25 
 
 
387 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.31 
 
 
376 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  47.94 
 
 
379 aa  340  3e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  46.23 
 
 
376 aa  338  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.96 
 
 
377 aa  337  3e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  1.86271e-08 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.41 
 
 
383 aa  337  3e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.48 
 
 
377 aa  335  6e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  3.16606e-10  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.06 
 
 
378 aa  335  9e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.39 
 
 
377 aa  332  7e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.25 
 
 
402 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  1.38278e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  45.71 
 
 
374 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.94 
 
 
376 aa  326  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  8.49521e-07  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.3 
 
 
374 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.04 
 
 
374 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.5514e-14 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.49 
 
 
386 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.61 
 
 
380 aa  320  2e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  45.19 
 
 
365 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  43.23 
 
 
374 aa  316  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  43.67 
 
 
378 aa  307  2e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  43.37 
 
 
384 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  43.01 
 
 
364 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  38.13 
 
 
374 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  34.9 
 
 
374 aa  251  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  36.99 
 
 
433 aa  233  4e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  38.94 
 
 
404 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.1 
 
 
369 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.49 
 
 
366 aa  185  1e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 
365 aa  182  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.31 
 
 
365 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 
374 aa  173  4e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  3.74529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.53 
 
 
375 aa  172  8e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 
378 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 
378 aa  166  7e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 
365 aa  166  7e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 
366 aa  163  5e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
366 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
366 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
374 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 
385 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 
377 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 
377 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.63 
 
 
380 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 
378 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.46 
 
 
385 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.46 
 
 
385 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  26.08 
 
 
376 aa  156  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 
388 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.92 
 
 
378 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 
397 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 
390 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 
366 aa  154  3e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  153  6e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 
372 aa  153  6e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.03 
 
 
376 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  152  9e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  152  9e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
381 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.07 
 
 
378 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.56 
 
 
385 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 
365 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 
377 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.07 
 
 
378 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
379 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 
385 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
381 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.15 
 
 
366 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.26321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 
373 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
381 aa  148  1e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
381 aa  148  1e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.16 
 
 
372 aa  148  1e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.29 
 
 
382 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.87 
 
 
374 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.05 
 
 
370 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.67 
 
 
393 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.67 
 
 
393 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  2.81863e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.84 
 
 
372 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.36 
 
 
366 aa  146  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
387 aa  146  8e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>