More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_R0046 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 73 bp  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  97.3 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  95.77 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  94.37 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  95.31 
 
 		 73 bp  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  95.31 
 
 		 73 bp  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0067  tRNA-Glu  95.08 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  96.23 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0077  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00689087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0024  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0025  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10740  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0961043  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0048  tRNA-Glu  91.8 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>