More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5779 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  216  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  216  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  216  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  88.07 
 
 
109 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  86.36 
 
 
110 aa  192  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  81.13 
 
 
116 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  69.81 
 
 
108 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  68.87 
 
 
108 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  73 
 
 
112 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  65.71 
 
 
107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  67.31 
 
 
108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  69.79 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  58.49 
 
 
107 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  59.43 
 
 
108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.6 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  61.54 
 
 
106 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  62.14 
 
 
108 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52.29 
 
 
109 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  57 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  55.66 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  60.19 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  61.17 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.43 
 
 
115 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.72 
 
 
109 aa  123  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  54.29 
 
 
106 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52.83 
 
 
108 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  56.86 
 
 
112 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  61.54 
 
 
141 aa  121  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  58 
 
 
110 aa  121  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  60.87 
 
 
112 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.74 
 
 
106 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  120  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  56.84 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  53.77 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  55.67 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  56.7 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  55.66 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.77 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  55.67 
 
 
107 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  55.67 
 
 
107 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  55.1 
 
 
108 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  116  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  51.38 
 
 
113 aa  116  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  51.46 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  51.49 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.89 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  49.54 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  53.54 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  56.73 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  56.25 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50.49 
 
 
120 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  49.52 
 
 
106 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  55.79 
 
 
108 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.68 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  56.7 
 
 
106 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.94 
 
 
109 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>