33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5552 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  66.46 
 
 
224 aa  226  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  48.73 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  47.14 
 
 
147 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  45.27 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  35.62 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  32.81 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  26.58 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  29.87 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  32.43 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  31.53 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  31.53 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  28.87 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  34.86 
 
 
212 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  26.49 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  30.97 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  31.06 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  31.86 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  33.04 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  32.46 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  28.7 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  30.33 
 
 
153 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 
153 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1594  N-6 Adenine-specific DNA methylase  34.88 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>