More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5292 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 374 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  83.07 
 
 		 358 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  76.7 
 
 		 360 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  75.24 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  74.11 
 
 		 366 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  74.76 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  75.08 
 
 		 353 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  74.76 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  72.03 
 
 		 357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  67.19 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  65.69 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  59.75 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  54.21 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  57.91 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  57.59 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  57.69 
 
 		 346 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  55.77 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  56.65 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  53.53 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  58.2 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  58.65 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  58.13 
 
 		 371 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  54.74 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  52.25 
 
 		 369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  54.89 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  52.87 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  48.77 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  48.77 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  50 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  48.42 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  49.84 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  48.55 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  46.8 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  50 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  47.55 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  45.51 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  44.73 
 
 		 314 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  40.88 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  43.08 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  41.53 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  39.17 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  39.23 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  40.65 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  40.13 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  39.42 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  41.25 
 
 		 341 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  40.73 
 
 		 341 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  40.4 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  36.3 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  40 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  37.45 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  34.53 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  29.32 
 
 		 902 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  33.99 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  32.91 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  29.21 
 
 		 877 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.84 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.71 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  31.01 
 
 		 608 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  28.24 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.1 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  34.98 
 
 		 852 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  29.6 
 
 		 285 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  33.6 
 
 		 847 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  30.55 
 
 		 656 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  28.91 
 
 		 871 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  31.01 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  31.01 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  30.47 
 
 		 847 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  33.47 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  30.28 
 
 		 603 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  30.5 
 
 		 861 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 311 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  33.88 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.47 
 
 		 822 aa  93.6  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.37 
 
 		 477 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  31.4 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34 
 
 		 858 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  29.15 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  29.55 
 
 		 939 aa  90.5  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.74 
 
 		 316 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  31.17 
 
 		 847 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  29.85 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  31.06 
 
 		 825 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  31.25 
 
 		 816 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.04 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  29.93 
 
 		 766 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 896 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  26.48 
 
 		 864 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.66 
 
 		 763 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 758 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  27.56 
 
 		 646 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  29.61 
 
 		 657 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  26.86 
 
 		 865 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  30.65 
 
 		 901 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  27.27 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  30.2 
 
 		 815 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.7 
 
 		 758 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.7 
 
 		 758 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>