46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5193 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  96.88 
 
 
353 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  96.88 
 
 
353 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  57.58 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  60.06 
 
 
365 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  60 
 
 
350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  44.74 
 
 
359 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  47.35 
 
 
355 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  41.74 
 
 
364 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  48.54 
 
 
371 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  41.95 
 
 
352 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  41.27 
 
 
366 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  35.78 
 
 
346 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  43.08 
 
 
359 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  43.09 
 
 
348 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  41.72 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  35.24 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  44.65 
 
 
357 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  34.08 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  37.69 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  31.21 
 
 
325 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  33.43 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  42.58 
 
 
569 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  32.41 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  42.44 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  36.94 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  37.07 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  38.1 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  36.32 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.87 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  31.78 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.25 
 
 
444 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  26.23 
 
 
587 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  32.77 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  27.16 
 
 
266 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  26.25 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  34.38 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  23.29 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.6 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  21.34 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  21.34 
 
 
270 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  25.86 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  43.21 
 
 
235 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.22 
 
 
265 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>