More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4841 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  89.97 
 
 
373 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  86.34 
 
 
375 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  99.73 
 
 
376 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  100 
 
 
376 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  89.67 
 
 
373 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  99.73 
 
 
376 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  88.59 
 
 
371 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  78.85 
 
 
371 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  76.29 
 
 
374 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  68.87 
 
 
368 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  74.09 
 
 
368 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  73.98 
 
 
389 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  70.52 
 
 
366 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  72.21 
 
 
378 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  73.54 
 
 
368 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  69.15 
 
 
368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  73.65 
 
 
377 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  68.63 
 
 
368 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  71.31 
 
 
368 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  71.19 
 
 
368 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  70.91 
 
 
368 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  71.02 
 
 
364 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  71.02 
 
 
369 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  69.47 
 
 
361 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  69.17 
 
 
370 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  54.66 
 
 
351 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  40.97 
 
 
388 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  42.25 
 
 
364 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  37.33 
 
 
391 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  36.63 
 
 
387 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  38.29 
 
 
364 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  38.98 
 
 
391 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  36.12 
 
 
395 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  36.49 
 
 
362 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  37.7 
 
 
362 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  46.57 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  33.24 
 
 
378 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.22 
 
 
430 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  33.95 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  34.99 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.31 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  34.69 
 
 
373 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.35 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.35 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.35 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  43.38 
 
 
377 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  32.09 
 
 
375 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  32.09 
 
 
375 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  32.27 
 
 
378 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.28 
 
 
374 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  33.6 
 
 
481 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  32.35 
 
 
375 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  29.87 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  30.97 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  31.55 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  31.28 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  32.98 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.68 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.2 
 
 
374 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  32.43 
 
 
375 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  32.43 
 
 
375 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  32.43 
 
 
375 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.95 
 
 
384 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  31.81 
 
 
386 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.61 
 
 
377 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  31.47 
 
 
371 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.59 
 
 
374 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.98 
 
 
372 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  30.38 
 
 
377 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.24 
 
 
374 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.54 
 
 
375 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  31.58 
 
 
380 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.54 
 
 
375 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  30.75 
 
 
379 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  30.75 
 
 
375 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.83 
 
 
375 aa  167  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  30.65 
 
 
374 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.66 
 
 
373 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  33.42 
 
 
378 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  33.42 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  30.33 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  31.37 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  32.39 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  30.33 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  32.99 
 
 
375 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  32.04 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  29.95 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  30.75 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  32.08 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  32.08 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  32.08 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  32.73 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.44 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  32.08 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  31.1 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  31.1 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  32.08 
 
 
382 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  32.08 
 
 
382 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  31 
 
 
382 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  32.04 
 
 
381 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>