More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4830 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  99.57 
 
 
233 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  99.57 
 
 
233 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  96.14 
 
 
233 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  94.85 
 
 
236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  96.14 
 
 
231 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  65.62 
 
 
243 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  65.62 
 
 
243 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  65.62 
 
 
243 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  64.29 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  64.29 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
228 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
228 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 
246 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  50.67 
 
 
230 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
224 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50 
 
 
231 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
225 aa  207  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.34 
 
 
271 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  48.02 
 
 
236 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
231 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
223 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 
236 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  47.09 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  50.89 
 
 
229 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 
238 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.37 
 
 
237 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.2 
 
 
236 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
233 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
233 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
225 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  46.49 
 
 
252 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  50 
 
 
234 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.89 
 
 
225 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.89 
 
 
225 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.89 
 
 
225 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  44.39 
 
 
225 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.44 
 
 
225 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 
224 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 
225 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 
225 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 
225 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
237 aa  191  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.89 
 
 
225 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 
229 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.85 
 
 
241 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  43.5 
 
 
227 aa  190  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  48 
 
 
225 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
222 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
240 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
227 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  46.02 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.77 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
225 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
246 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
240 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
223 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 
225 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  46.64 
 
 
234 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  45.78 
 
 
228 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.98 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.1 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 
230 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 
223 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
228 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
223 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.74 
 
 
225 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  45.09 
 
 
247 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.04 
 
 
238 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
227 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
246 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 
225 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
227 aa  185  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.61 
 
 
257 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 
223 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 
224 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
225 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
230 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 
225 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 
229 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>