More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4528 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  100 
 
 
370 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  66.86 
 
 
363 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  65.01 
 
 
363 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  67.46 
 
 
348 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  65.18 
 
 
363 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  67.16 
 
 
348 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  67.46 
 
 
348 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  58.42 
 
 
378 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  63.54 
 
 
372 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  65.98 
 
 
348 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  63.54 
 
 
372 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  64 
 
 
361 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  64 
 
 
361 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  57.51 
 
 
378 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
372 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  55.06 
 
 
393 aa  345  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  37.85 
 
 
347 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40.43 
 
 
348 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.35 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.33 
 
 
340 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  31.45 
 
 
330 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  56.03 
 
 
232 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.33 
 
 
343 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  53.47 
 
 
365 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  53.47 
 
 
365 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  52.24 
 
 
365 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
350 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30.7 
 
 
366 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  50.89 
 
 
227 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  51.5 
 
 
370 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  29.69 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  59.79 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  51.26 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  53.64 
 
 
164 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  56.12 
 
 
446 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  29.39 
 
 
306 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.36 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.36 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
371 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.54 
 
 
337 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  27.09 
 
 
342 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  26.61 
 
 
323 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.92 
 
 
235 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
173 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.44 
 
 
334 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  42.59 
 
 
315 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.31 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  28.52 
 
 
337 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.01 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.27 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  29.07 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.23 
 
 
459 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  43.8 
 
 
432 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.8 
 
 
432 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  43.2 
 
 
225 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 
438 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.45 
 
 
281 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.97 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.04 
 
 
476 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  43.7 
 
 
226 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  50 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  42.72 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  29.58 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
173 aa  92.8  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.98 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
188 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
162 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  46 
 
 
160 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
859 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  29.12 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
265 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.71 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.26 
 
 
236 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.18 
 
 
222 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
177 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.89 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.12 
 
 
291 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
177 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  29.14 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.87 
 
 
501 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  30.99 
 
 
517 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
223 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  34.78 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
223 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.82 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.57 
 
 
232 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>