95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4477 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  100 
 
 		 370 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  61.64 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  61.64 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  61.64 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  59.35 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  59.03 
 
 		 541 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  57.92 
 
 		 539 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  37.03 
 
 		 654 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  49.47 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  38.44 
 
 		 928 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  38.46 
 
 		 879 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.5 
 
 		 905 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.79 
 
 		 591 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.47 
 
 		 959 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  42.35 
 
 		 694 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  39.47 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.9 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.67 
 
 		 728 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.43 
 
 		 552 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.35 
 
 		 784 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.9 
 
 		 636 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.13 
 
 		 794 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.76 
 
 		 1072 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  34.58 
 
 		 486 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.06 
 
 		 964 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.87 
 
 		 950 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 964 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.77 
 
 		 366 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.72 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.35 
 
 		 684 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  32.66 
 
 		 289 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.7 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  42.86 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.2 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  45.71 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.91 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  44.68 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.05 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  41.12 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.57 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.19 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  38.89 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.91 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  31.43 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  43.62 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  35.58 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  35.2 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  39.45 
 
 		 867 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  39.22 
 
 		 475 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.48 
 
 		 542 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  41.46 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  27.59 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  38.46 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.46 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.46 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3053  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.82 
 
 		 792 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0646042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.6 
 
 		 150 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.84 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.71 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.1 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.1 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.58 
 
 		 892 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  43.21 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.1 
 
 		 152 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  24.43 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  35 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.81 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  29.38 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  27.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 706 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  36.04 
 
 		 686 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 705 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  33.33 
 
 		 754 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5184  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.95 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.14 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  36.36 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.37 
 
 		 223 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 967 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 150 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 150 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  26.56 
 
 		 780 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.6 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.27 
 
 		 799 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00111453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.12 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.32 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.24 
 
 		 173 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 496 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  31 
 
 		 1040 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  22.58 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  28.83 
 
 		 699 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>