21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4450 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  88.06 
 
 
525 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  100 
 
 
427 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  89.62 
 
 
377 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  45.75 
 
 
545 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  42.24 
 
 
880 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  39 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  33.52 
 
 
650 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  34.22 
 
 
535 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  31.39 
 
 
576 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  34.97 
 
 
701 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  37.5 
 
 
636 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  38.66 
 
 
643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
572 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  28.57 
 
 
866 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  32.58 
 
 
739 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  34.09 
 
 
685 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  34.72 
 
 
399 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.55 
 
 
746 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  34.76 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4918  putative ATP-binding protein  77.42 
 
 
160 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  29.93 
 
 
1027 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>