More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4448 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  100 
 
 		 424 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  52.64 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  41.67 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  38.94 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  72.14 
 
 		 151 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  35.19 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  36.89 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  37.7 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  38.19 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  37.63 
 
 		 367 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  36.09 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11073  integrase  84.52 
 
 		 118 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.524499  normal  0.0660642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  28.97 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30.75 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.09 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.67 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.71 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  26.26 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  31.09 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.95 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.6 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.14 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.86 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  29.65 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.59 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.59 
 
 		 370 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.38 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.04 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  26.77 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.32 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.79 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.49 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.16 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  33.01 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.07 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.44 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.83 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.38 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.61 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.77 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.79 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.8 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.89 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.12 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.84 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.15 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.16 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.42 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.53 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.3 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.49 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  27.24 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.91 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.84 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.51 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.53 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  27.61 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.44 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.28 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.15 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.16 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.16 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.14 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.96 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.77 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  27.39 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.77 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13783  integrase  53.97 
 
 		 71 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.763684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  38.83 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.26 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.89 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  31.6 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.21 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  26.69 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  31.96 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  29.62 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  26.39 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.36 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.1 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.36 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.88 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.99 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25 
 
 		 506 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>