136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4393 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4393  patatin  100 
 
 		 301 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  99.34 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  99.34 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  69.26 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  69.96 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  68.31 
 
 		 294 aa  362  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  41.91 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  43.77 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  34.44 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  35.64 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  37.87 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  35.77 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  36.96 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  38.96 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.23 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  36.94 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  32.23 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  35.94 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  34.48 
 
 		 351 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  31.36 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  30.43 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  35.94 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  33.05 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.11 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.36 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  29.61 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  29.66 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  26.77 
 
 		 377 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.44 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  38.27 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  33.19 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.8 
 
 		 748 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.48 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.57 
 
 		 727 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  25.82 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  27.31 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.04 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  25.98 
 
 		 377 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.66 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  30.13 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.85 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.85 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.58 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  29.13 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.19 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  25.45 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.14 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  28.16 
 
 		 434 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  27.44 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.78 
 
 		 746 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.19 
 
 		 728 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.11 
 
 		 728 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.11 
 
 		 751 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.43 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.11 
 
 		 728 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.57 
 
 		 667 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 728 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  28.74 
 
 		 389 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.65 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.57 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  29.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  32.41 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  26.7 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  28.8 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  28.46 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  35.71 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.46 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  37.5 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.86 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.99 
 
 		 474 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.68 
 
 		 733 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  24.74 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  25 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.24 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.24 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.24 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  35.35 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  26.67 
 
 		 420 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.08 
 
 		 790 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.5 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  31.03 
 
 		 405 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.5 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27.98 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.24 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.67 
 
 		 358 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  37.88 
 
 		 379 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  28.71 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  27.19 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  28.57 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.01 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  30.23 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  30.23 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  25.13 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  29.23 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  40 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.49 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.6 
 
 		 728 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.49 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  33.01 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>