More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4279 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
403 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
403 aa  780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
403 aa  780    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  83.33 
 
 
408 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  83.38 
 
 
409 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  73.23 
 
 
402 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  58.75 
 
 
408 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  53.66 
 
 
394 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  56.43 
 
 
408 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  53.69 
 
 
398 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  56.33 
 
 
411 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  52.94 
 
 
394 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  52.63 
 
 
394 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  52.77 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  52.66 
 
 
391 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  48.17 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  51.69 
 
 
405 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  51.44 
 
 
393 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  49.25 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  41.48 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  48.7 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  48.33 
 
 
432 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  48.01 
 
 
363 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  44.83 
 
 
325 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  55.29 
 
 
338 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  36.51 
 
 
455 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 
450 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  36.97 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.99 
 
 
465 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  33.42 
 
 
426 aa  189  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  43.67 
 
 
576 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.72 
 
 
576 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 
572 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.72 
 
 
578 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  39.53 
 
 
580 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 
589 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  29.92 
 
 
589 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  38.18 
 
 
645 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 
568 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 
522 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  29.46 
 
 
591 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  30.52 
 
 
603 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 
568 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.92 
 
 
576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  40.67 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  27.65 
 
 
563 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  36.33 
 
 
559 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.82 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.51 
 
 
567 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
565 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  29.03 
 
 
556 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
446 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  39.38 
 
 
433 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  26.97 
 
 
556 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  25.81 
 
 
565 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 
438 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  37.61 
 
 
431 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  33.72 
 
 
575 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  26.25 
 
 
565 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 
561 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  26.96 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  27.05 
 
 
572 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  27.3 
 
 
572 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  27.2 
 
 
584 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 
563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  27.2 
 
 
584 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  30.39 
 
 
414 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  27.32 
 
 
562 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
561 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
561 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
561 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
561 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  26.91 
 
 
561 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  25.99 
 
 
561 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  26.49 
 
 
561 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  28.61 
 
 
568 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
561 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  36.04 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  25.99 
 
 
561 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
561 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.78 
 
 
563 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  34.5 
 
 
558 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 
1018 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  34.72 
 
 
560 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  34.72 
 
 
560 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  28.23 
 
 
577 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>