240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4255 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  74.21 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  70.13 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  59.55 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  58.39 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  53.9 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  58.64 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  57.72 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  54.19 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  52.24 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  53.46 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  52.9 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  54.07 
 
 		 306 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  52.92 
 
 		 308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  51.79 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  51.13 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  48.73 
 
 		 317 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  49.19 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  52.1 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  49.35 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  49.19 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  49.19 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  48.85 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  46.98 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  40.39 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  36.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  36.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  35.99 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  36.01 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  36.66 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.03 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  36.98 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  39.93 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  40.85 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  39.5 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  36.74 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  36.89 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  37.94 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  36.33 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  31.8 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  35.31 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  35.99 
 
 		 279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  31.05 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  31.05 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  37.37 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  34.38 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  35.2 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  35.22 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  36.49 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  35.07 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  30.69 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.37 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  25.97 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 		 993 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.21 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  34.03 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.82 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.85 
 
 		 996 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.78 
 
 		 1001 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.61 
 
 		 1003 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.25 
 
 		 1006 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.45 
 
 		 1013 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.99 
 
 		 993 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.38 
 
 		 1040 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.13 
 
 		 990 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.06 
 
 		 991 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.06 
 
 		 991 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  25.98 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.78 
 
 		 991 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.91 
 
 		 1004 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1004 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0570  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.94 
 
 		 1241 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.78 
 
 		 1043 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.21 
 
 		 1001 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.91 
 
 		 1002 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0308  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.71 
 
 		 1085 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.048295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.25 
 
 		 1003 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.84 
 
 		 1043 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.34 
 
 		 1055 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2931  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 		 1323 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.637197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 		 1323 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01017  fused DNA-binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.3 
 
 		 1320 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01024  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1320 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 		 1221 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1541  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.98 
 
 		 1320 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174773 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.03 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2628  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.3 
 
 		 1320 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  29.51 
 
 		 1028 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4322  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.43 
 
 		 1178 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>