More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4191 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.58 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 187 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  26.54 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.55 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.26 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  38.98 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.31 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  20.23 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 72 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>