203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4182 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
398 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
446 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 
307 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
497 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  39.68 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  43.4 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
210 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 
204 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
196 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  35.06 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
302 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  36.07 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
204 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  18.34 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.36 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  25.29 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>