More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3913 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  100 
 
 		 387 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  41.04 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  42.56 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  39.8 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  38.93 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 385 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  39.4 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  37.37 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  36.72 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  32.01 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  30.95 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  29.75 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  42.05 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.61 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.67 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.57 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.93 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.82 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.22 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  26.91 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  27.05 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.55 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.44 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  24.1 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.77 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.33 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.78 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.55 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.87 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.57 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.41 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.69 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.63 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  23.15 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.9 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.92 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  32.54 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  28.39 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.15 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.92 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.87 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  27.79 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.35 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.71 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.71 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  28.3 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.03 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.03 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.74 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.83 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  27.7 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.75 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.28 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  28.81 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.52 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.2 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.3 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.61 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.35 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.53 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.34 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.6 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  21.71 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.57 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.34 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.47 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.22 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.68 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.59 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.97 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.71 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.82 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  24.66 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.46 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  33.49 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.62 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.95 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  24.76 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.6 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  25.76 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.5 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  23.48 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  29.24 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  28.57 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  20.98 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>