127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3484 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  72.17 
 
 
507 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  80.79 
 
 
507 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  72.17 
 
 
507 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  80.79 
 
 
507 aa  780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  75.5 
 
 
519 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  76.81 
 
 
510 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  76.7 
 
 
508 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  70.56 
 
 
508 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  74.24 
 
 
511 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  72.17 
 
 
507 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1123    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  81.37 
 
 
507 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  75.86 
 
 
519 aa  816    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  75.27 
 
 
489 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  78.85 
 
 
506 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  75.94 
 
 
501 aa  727    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  82.72 
 
 
355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  47.3 
 
 
495 aa  399  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  46.31 
 
 
513 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  45.9 
 
 
518 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  49.12 
 
 
451 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  47.11 
 
 
464 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  46.62 
 
 
497 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  44.15 
 
 
444 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  44.15 
 
 
444 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  43.27 
 
 
444 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  43.49 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.47 
 
 
454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  43.11 
 
 
492 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  43.11 
 
 
492 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  43.54 
 
 
492 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  43.11 
 
 
493 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  43.5 
 
 
446 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  42.09 
 
 
442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  42.09 
 
 
442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  44.3 
 
 
499 aa  327  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  45.23 
 
 
454 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  41.43 
 
 
490 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  42.38 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  42.38 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  44.01 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  44.01 
 
 
448 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  43.28 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  52.34 
 
 
317 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  55.14 
 
 
239 aa  230  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  55.13 
 
 
240 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  61.86 
 
 
158 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  37.13 
 
 
531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  37.07 
 
 
540 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  34.43 
 
 
551 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  35.41 
 
 
532 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  34.52 
 
 
553 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  36.39 
 
 
437 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  33.82 
 
 
593 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  33.82 
 
 
524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  31.98 
 
 
534 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  33.08 
 
 
533 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.03 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.49 
 
 
561 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  31.46 
 
 
387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.18 
 
 
442 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.94 
 
 
572 aa  97.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  26.9 
 
 
469 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  31.18 
 
 
485 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  26.92 
 
 
627 aa  87.8  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.39 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.76 
 
 
661 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.24 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  37.14 
 
 
260 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.62 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  36.03 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  27.75 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.52 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  31.93 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  51.47 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  27.36 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  27.05 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  27.36 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  26.6 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  26.4 
 
 
433 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  46.05 
 
 
87 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  46.05 
 
 
87 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  27.39 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  27.16 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  36.15 
 
 
222 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  31.87 
 
 
440 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  25.44 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  25.44 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  38.46 
 
 
104 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  38.46 
 
 
104 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  26.43 
 
 
414 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  38.64 
 
 
464 aa  53.9  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  45.07 
 
 
441 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  25.69 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  24.57 
 
 
275 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  25.67 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.78 
 
 
566 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  26.49 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>