71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3333 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  66.67 
 
 
185 aa  209  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  62.84 
 
 
148 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  53.28 
 
 
141 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  48.85 
 
 
130 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  47.66 
 
 
133 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  48.36 
 
 
130 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  43.85 
 
 
147 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  44.53 
 
 
130 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  41.26 
 
 
150 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  46.88 
 
 
134 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  45.52 
 
 
140 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  42.31 
 
 
156 aa  94.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  43.61 
 
 
135 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  42.03 
 
 
133 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  44.19 
 
 
136 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  44.44 
 
 
131 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  46.34 
 
 
134 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  43.85 
 
 
130 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  44.17 
 
 
134 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  40.58 
 
 
133 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  44.7 
 
 
133 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  44.44 
 
 
136 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  44.78 
 
 
131 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  41.67 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  41.22 
 
 
153 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  46.15 
 
 
130 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  43.28 
 
 
132 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  40.31 
 
 
144 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  39.71 
 
 
143 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  41.86 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  47.11 
 
 
143 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  42.97 
 
 
125 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  40.88 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  42.34 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  40.69 
 
 
143 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  44 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  41.04 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  41.84 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  38.81 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  36.84 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  41.43 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  41.98 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  37.59 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  38.64 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35.38 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.85 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.1 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.62 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.92 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  34.51 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.52 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.13 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  35.48 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.31 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  34.92 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.71 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.92 
 
 
134 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  37.3 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.07 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  35.16 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.01 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.5 
 
 
151 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  33.33 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  33.33 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.03 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  28.57 
 
 
137 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>