More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3298 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  98.92 
 
 
372 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  98.92 
 
 
372 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  100 
 
 
372 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  70.45 
 
 
378 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  70.71 
 
 
378 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  59.16 
 
 
393 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  57.75 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  60.96 
 
 
370 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  59.36 
 
 
348 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  58.48 
 
 
348 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  58.77 
 
 
348 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  59.06 
 
 
348 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  55.92 
 
 
363 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  54.7 
 
 
363 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  52.84 
 
 
361 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  52.84 
 
 
361 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.14 
 
 
348 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.05 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.23 
 
 
343 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.85 
 
 
340 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  29.52 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
446 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  33.53 
 
 
366 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  47.18 
 
 
232 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.86 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.63 
 
 
335 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  34.73 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  52.94 
 
 
370 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  51.46 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  51.46 
 
 
365 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  51.46 
 
 
365 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  45.16 
 
 
364 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  50.89 
 
 
342 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.98 
 
 
327 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.84 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
348 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  32.22 
 
 
345 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  47.71 
 
 
227 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  29.54 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  50.5 
 
 
164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  52.29 
 
 
380 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  45.79 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
173 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  26.61 
 
 
337 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
417 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.42 
 
 
235 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.37 
 
 
331 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  28.23 
 
 
306 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  30.65 
 
 
394 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  46 
 
 
333 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.68 
 
 
391 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  24.72 
 
 
334 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  25.36 
 
 
323 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.51 
 
 
319 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.76 
 
 
459 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
333 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.02 
 
 
222 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  43.36 
 
 
432 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.12 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
162 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  28.83 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.62 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.55 
 
 
281 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  52.38 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.37 
 
 
217 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
469 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
469 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.51 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
469 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.28 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
469 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  39.16 
 
 
472 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.57 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  37.32 
 
 
467 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.45 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  27.99 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
188 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
240 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
224 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 
531 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
452 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.18 
 
 
224 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  36.62 
 
 
467 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
453 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  36.62 
 
 
467 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40 
 
 
223 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  36.88 
 
 
478 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>