42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3281 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  993    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  70.91 
 
 		 516 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  993    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  78.29 
 
 		 529 aa  732    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  74.4 
 
 		 527 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  55.04 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  42.22 
 
 		 505 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  37.04 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  42.22 
 
 		 486 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  32.93 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  31.98 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  35.05 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  31.8 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  31.87 
 
 		 579 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  31.87 
 
 		 579 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  33.98 
 
 		 527 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  33.18 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  31.77 
 
 		 572 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  31.29 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  30.58 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  29.64 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  31.83 
 
 		 607 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  30.37 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  29.23 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  32.64 
 
 		 539 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  30.57 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  37.11 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  30.75 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  31.01 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  28.14 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  34.91 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  31.37 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  34.15 
 
 		 529 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  39.44 
 
 		 500 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  31.95 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  38.73 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  29.9 
 
 		 592 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  32.45 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05415  hypothetical protein  21.73 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.671814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.24 
 
 		 551 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  28.5 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>