161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3005 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  328  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  93.98 
 
 
166 aa  313  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  93.98 
 
 
166 aa  313  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  75.31 
 
 
163 aa  248  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  74.07 
 
 
163 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  61.45 
 
 
166 aa  204  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  61.96 
 
 
164 aa  200  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  60.74 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  59.51 
 
 
175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  61.35 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  60.74 
 
 
169 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  59.75 
 
 
163 aa  187  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  59.75 
 
 
165 aa  183  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  54.94 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  55.42 
 
 
166 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  58.55 
 
 
164 aa  178  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  53.37 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  52.53 
 
 
165 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  55.35 
 
 
162 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  56.6 
 
 
165 aa  174  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  51.85 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  53.99 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  55.35 
 
 
160 aa  171  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  50.6 
 
 
166 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  47.85 
 
 
164 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  47.85 
 
 
164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  51.32 
 
 
175 aa  157  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  50.34 
 
 
156 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  51.5 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  53.66 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  44.79 
 
 
164 aa  141  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  49.34 
 
 
158 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  47.37 
 
 
156 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  48.67 
 
 
160 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  41.72 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  38.35 
 
 
270 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  38.54 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  34.35 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  39.33 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  39.33 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  38.46 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  38.2 
 
 
118 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  33.62 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  34.09 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  32.14 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  35.42 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  40.51 
 
 
118 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  34.21 
 
 
124 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  31.96 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  35.87 
 
 
129 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  29.57 
 
 
127 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  42.35 
 
 
102 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  43.21 
 
 
94 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  34.17 
 
 
135 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  28.79 
 
 
265 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  37.5 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  27.97 
 
 
248 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  27.61 
 
 
125 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  29.46 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  31.87 
 
 
122 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  33.71 
 
 
118 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  33.06 
 
 
125 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  31.46 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  40.74 
 
 
94 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  35 
 
 
264 aa  57.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  33.71 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 
517 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  34.31 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  34.58 
 
 
119 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  28.15 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  28.1 
 
 
124 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  31.19 
 
 
265 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  40.85 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  31.01 
 
 
258 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  27.18 
 
 
125 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  30 
 
 
213 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  30.61 
 
 
130 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  31.33 
 
 
93 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  29.21 
 
 
121 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  31.46 
 
 
120 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  38.75 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  32.71 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  39.44 
 
 
93 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  41.94 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  27.97 
 
 
120 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>