44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2831 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  99.53 
 
 
211 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  100 
 
 
211 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  99.53 
 
 
211 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  72.43 
 
 
214 aa  292  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  67.3 
 
 
211 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  74.3 
 
 
214 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  60.1 
 
 
216 aa  198  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  44.09 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  44.26 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  47.06 
 
 
244 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  41.78 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  46.4 
 
 
220 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  38.33 
 
 
243 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  45.7 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  35.29 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  36.45 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  33.97 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  43.4 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  39.86 
 
 
302 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  27.23 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  34.21 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.18 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  23.87 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  28.7 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  30.91 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.59 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  24.71 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  27.63 
 
 
243 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  32.75 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.49 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.07 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  23.45 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  23.45 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  23.45 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  29.91 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  31.47 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  38 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  21.55 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  38 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>