55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2695 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  99.73 
 
 
370 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  99.73 
 
 
370 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
370 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  81.59 
 
 
358 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  66.57 
 
 
359 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  65.17 
 
 
359 aa  474  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  61.6 
 
 
354 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  61.6 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  61.32 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  61.14 
 
 
354 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  60.46 
 
 
355 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  60.06 
 
 
353 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 
350 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  40.14 
 
 
291 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.82 
 
 
331 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  28.38 
 
 
334 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.03 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25 
 
 
341 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 
371 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  24.64 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  24.64 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  27.11 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  25 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  23.91 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  21.14 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  23.6 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  20.47 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.51 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  23.02 
 
 
426 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  23.48 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  20.56 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  24.21 
 
 
371 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  21.88 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  23.12 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  21.61 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>