47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2690 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  70 
 
 
197 aa  265  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  63.83 
 
 
211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  46.67 
 
 
191 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  47.25 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  41.45 
 
 
298 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  34.29 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  38.99 
 
 
204 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  31.77 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  34.46 
 
 
233 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  27.05 
 
 
247 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  35.33 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  36.65 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  34.52 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  35.67 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  32.07 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  35.19 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  32.61 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  34.08 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  35.07 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  28.96 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  33.54 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  38.18 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  32.47 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  34.64 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  25.51 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  31.46 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  33.75 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  30.57 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  33.15 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  32.05 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  27.59 
 
 
248 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  32.33 
 
 
175 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4157  hypothetical protein  47.3 
 
 
104 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
98 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  32.86 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  30.57 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  27.07 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  29.38 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>