215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2651 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  99.66 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  59.79 
 
 		 293 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 298 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  56.23 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  56.66 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  56.23 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  55.04 
 
 		 297 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  57.73 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  56.07 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  52.9 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  53.71 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  54.42 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  53.71 
 
 		 292 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  51.71 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  53.55 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  51.34 
 
 		 334 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  52.86 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  51.42 
 
 		 307 aa  254  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  48.96 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  49.12 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  49.5 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  45.91 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  47.12 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  48.75 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  47.12 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  46.57 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  43.53 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  42.27 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  45.72 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  44.72 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  43.59 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  45.82 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.35 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  42.46 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  42.6 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.13 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  38.08 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  38.08 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.41 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.37 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  37.73 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.98 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  36.73 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.97 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.98 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  40.89 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.17 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38.99 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.51 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  36.65 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  40.73 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  37.2 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  38.28 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37.3 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  37.67 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>