More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2544 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 413 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 413 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 413 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  79.02 
 
 		 436 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  78.03 
 
 		 409 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  48.36 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  38.02 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  35.49 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  35.7 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  38.87 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  46.34 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  50 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  50.81 
 
 		 521 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  34.31 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  47.46 
 
 		 531 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  51.33 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  46.09 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  51.52 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  49.56 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 283 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 273 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  32.23 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 263 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  36.89 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 266 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  28.41 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.09 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.5 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.36 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  37.01 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  24.83 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.5 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.35 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  36.23 
 
 		 977 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  29.48 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.64 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.1 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.91 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  23.64 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  33.96 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  29.18 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.8 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 		 255 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.29 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  35 
 
 		 1080 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2502  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2687  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 250 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.63 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>