More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2481 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  100 
 
 
121 aa  247  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  99.17 
 
 
121 aa  246  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  99.17 
 
 
121 aa  246  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  86.67 
 
 
120 aa  201  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  77.5 
 
 
120 aa  184  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  75.21 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  74.77 
 
 
122 aa  178  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  68.42 
 
 
122 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  68.52 
 
 
124 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  67.59 
 
 
124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  67.59 
 
 
124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  65.74 
 
 
124 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  67.59 
 
 
143 aa  156  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  63.16 
 
 
126 aa  153  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  58.54 
 
 
123 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  59.5 
 
 
125 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  58.68 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  68.42 
 
 
126 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  58.82 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  60.55 
 
 
126 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  60.53 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  60.55 
 
 
123 aa  143  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  58.72 
 
 
123 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  58.77 
 
 
120 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  59.46 
 
 
120 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  53.23 
 
 
154 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.63 
 
 
126 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  58.72 
 
 
120 aa  141  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  54.55 
 
 
123 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  54.39 
 
 
125 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.07 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  52.89 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  53.85 
 
 
117 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  53.57 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  56.88 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  50.81 
 
 
125 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  55.05 
 
 
125 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  54.95 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  53.39 
 
 
124 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  53.15 
 
 
132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  56.41 
 
 
123 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  53.15 
 
 
132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  50.81 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  58.1 
 
 
121 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  52.5 
 
 
123 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  55.05 
 
 
139 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  50.41 
 
 
123 aa  133  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  58.49 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  53.21 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  53.21 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  52.14 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  57.41 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  57.98 
 
 
130 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  48.78 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  46.77 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  59.17 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  53.21 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  52.94 
 
 
122 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  51.69 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  46.28 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  47.93 
 
 
125 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  53.92 
 
 
124 aa  116  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  48.54 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  39.66 
 
 
120 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  39.66 
 
 
120 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  50.51 
 
 
140 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  50.51 
 
 
140 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  48.51 
 
 
170 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  47.62 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  48.48 
 
 
170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  48.48 
 
 
170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  48.48 
 
 
170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  47.06 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  44.12 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  48.48 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  45.1 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  47.96 
 
 
142 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  44.23 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  43.27 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  46.46 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  31.67 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  31.67 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  48 
 
 
140 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  48.48 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.89 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  45.45 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  50 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  44.33 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  42.11 
 
 
135 aa  89  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  53.12 
 
 
149 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  45 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  44.21 
 
 
144 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  43.3 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  43.3 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  43.3 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  43.3 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  42.27 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  43.3 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  48.04 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  46.39 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>