41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2470 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  99.48 
 
 
579 aa  1113    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  99.48 
 
 
579 aa  1113    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  85.34 
 
 
572 aa  867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1120    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  82.03 
 
 
551 aa  880    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  72.41 
 
 
591 aa  772    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  51.71 
 
 
594 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  49.22 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  42.88 
 
 
543 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  45.23 
 
 
527 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  38.96 
 
 
516 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  38.28 
 
 
557 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  41.9 
 
 
539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  33.19 
 
 
529 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  31.66 
 
 
527 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  33.33 
 
 
516 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  30.72 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.73 
 
 
510 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.73 
 
 
510 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.73 
 
 
510 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  29.61 
 
 
508 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  29.94 
 
 
518 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.41 
 
 
505 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  31.14 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  30.06 
 
 
563 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  32.92 
 
 
575 aa  147  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.29 
 
 
498 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  28.04 
 
 
546 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.76 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  32.67 
 
 
522 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  43.6 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.02 
 
 
509 aa  114  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  35.16 
 
 
472 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  32.75 
 
 
495 aa  97.1  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  37.95 
 
 
500 aa  97.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  29.93 
 
 
522 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  30.88 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  28.49 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  35.06 
 
 
632 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  31.62 
 
 
519 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.17 
 
 
551 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>