More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2459 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  99.77 
 
 
443 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  99.77 
 
 
443 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
443 aa  893    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  70 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  69.59 
 
 
444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  58.74 
 
 
432 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 
424 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.81 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.21 
 
 
422 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
498 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
455 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
455 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.16 
 
 
443 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  28.89 
 
 
436 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
452 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
428 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  29.68 
 
 
436 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
450 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
437 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
435 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.1 
 
 
438 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  27.45 
 
 
436 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
436 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.53 
 
 
496 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
419 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
431 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
438 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 
470 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.67 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
449 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
436 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
437 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.78 
 
 
431 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
436 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
428 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.51 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
428 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25.48 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
443 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
422 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
415 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
435 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
435 aa  87  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  27.6 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.6 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.6 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.6 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.6 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.78 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.91 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
410 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  26.76 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.96 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.22 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.37 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.39 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.96 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.51 
 
 
675 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>