More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2404 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
316 aa  627  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.68 
 
 
316 aa  627  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.68 
 
 
316 aa  627  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  89.81 
 
 
315 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.85 
 
 
315 aa  564  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.66 
 
 
319 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  83.28 
 
 
318 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  79.42 
 
 
316 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  75.88 
 
 
310 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  75.81 
 
 
311 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.63 
 
 
328 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  68.93 
 
 
306 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  67.1 
 
 
313 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  67.21 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  66.88 
 
 
309 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.73 
 
 
313 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
323 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  66.78 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  66.13 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  66.78 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.74 
 
 
309 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.04 
 
 
324 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
318 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.3 
 
 
323 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
308 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.06 
 
 
308 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  61.35 
 
 
335 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  63.09 
 
 
332 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  61.54 
 
 
351 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  60.61 
 
 
327 aa  362  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.62 
 
 
342 aa  360  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  58.98 
 
 
349 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.24 
 
 
337 aa  358  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  58.13 
 
 
333 aa  355  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  60.06 
 
 
319 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  59.29 
 
 
320 aa  347  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  54.31 
 
 
312 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  53.07 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  52.94 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.14 
 
 
312 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.53 
 
 
311 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
307 aa  305  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.13 
 
 
313 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.26 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
307 aa  302  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
315 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
315 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.39 
 
 
311 aa  298  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 
314 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
315 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
312 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.49 
 
 
311 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.55 
 
 
325 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.12 
 
 
318 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  52.83 
 
 
329 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
336 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.1 
 
 
313 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
317 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
317 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  48.06 
 
 
312 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
334 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.32 
 
 
323 aa  291  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
317 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  51.3 
 
 
313 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
306 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.47 
 
 
311 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
313 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
313 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
313 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.18 
 
 
307 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.66 
 
 
323 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
316 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.66 
 
 
323 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.16 
 
 
316 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
315 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.24 
 
 
314 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  51.13 
 
 
320 aa  287  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.66 
 
 
323 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
328 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  49.36 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.75 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.83 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  49.83 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
362 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  51.62 
 
 
314 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  46.69 
 
 
309 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
317 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
336 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
334 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
334 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.34 
 
 
310 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>