More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2258 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.7 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  49.44 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  46.63 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.75 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  44.51 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.07 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  46.63 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  45.71 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  47.19 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  47.19 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.06 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  42.47 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  43.26 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  43.26 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  43.26 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.49 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  46.77 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  44.86 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  46.77 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  43.65 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  43.65 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  46.02 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  43.41 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  47.16 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  43.96 
 
 		 309 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  44.15 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.67 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  45.7 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.45 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.56 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.02 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  43.53 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  45.16 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  45.16 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  45.16 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.96 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  42.47 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  44.68 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.76 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  44.75 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  44.2 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.57 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.85 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.59 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.44 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  42.7 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  41.21 
 
 		 189 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  40.88 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  42.54 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  42.54 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.3 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.34 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  43.41 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  44.44 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  44.44 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  44.44 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  40.11 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  40.11 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  43.58 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.96 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>