175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2226 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 451 aa  931    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  44.14 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  47.71 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  34.03 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  35.82 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  48.17 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  31.4 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  28.98 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  31.03 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  31.47 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  35.67 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.2 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  29.28 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  31.57 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.82 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  39.15 
 
 		 386 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  30.74 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  30.07 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  34.19 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  29.04 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  31.09 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.03 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  29.37 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 		 462 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  26.61 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.82 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  28.72 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  28.79 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.51 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  35.77 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  27.2 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  24.9 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.68 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.41 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  28.99 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  25.48 
 
 		 463 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  26.45 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  27.35 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  26.48 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  28.76 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.37 
 
 		 238 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  25.33 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  27.11 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  24.83 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  34.03 
 
 		 585 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  34.39 
 
 		 584 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  24.56 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  24.84 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  28.28 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  29.03 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.79 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.65 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  27.52 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.83 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  30.59 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  27.32 
 
 		 354 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.89 
 
 		 457 aa  93.2  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  25.64 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  24.02 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  24.84 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  23.03 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.59 
 
 		 237 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  23.12 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  25.97 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  20.6 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  24.36 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.37 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.37 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.32 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  25.94 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  25.78 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  26.11 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  24.32 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  29.53 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  23.92 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.62 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.09 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.24 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  27.38 
 
 		 575 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.73 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  22.56 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02074  HsdS polypeptide, part of CfrA family  35.96 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  25.11 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.41 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  21.65 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  27.54 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  20.15 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0307222  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  20.05 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  21.46 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  26.07 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  27.34 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  24.41 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.83 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  21.27 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  21.29 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.81 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  22.58 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>