231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2196 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  99.55 
 
 
441 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  99.78 
 
 
450 aa  860    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
450 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  75.51 
 
 
447 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  74.83 
 
 
464 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  69.82 
 
 
461 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  66.67 
 
 
434 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  68.07 
 
 
462 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.53 
 
 
449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  69.89 
 
 
463 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.36 
 
 
461 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.67 
 
 
442 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  66.2 
 
 
432 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  64.8 
 
 
437 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  63.96 
 
 
429 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  62.88 
 
 
434 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  56.6 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.63 
 
 
436 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.96 
 
 
436 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  59.46 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  57.61 
 
 
453 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  57.54 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.48 
 
 
539 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  50.24 
 
 
422 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  50.35 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  53.12 
 
 
408 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50.48 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  51.07 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  47.24 
 
 
433 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  50.25 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  56.1 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  50.35 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  47.65 
 
 
402 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  49.88 
 
 
390 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  47.98 
 
 
413 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  49.35 
 
 
436 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.75 
 
 
394 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  43.52 
 
 
391 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  39.04 
 
 
394 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  52.02 
 
 
447 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  42.86 
 
 
425 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
391 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.41 
 
 
404 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.25 
 
 
409 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.82 
 
 
389 aa  250  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.99 
 
 
391 aa  250  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 
391 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.33 
 
 
399 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.34 
 
 
391 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.51 
 
 
398 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.72 
 
 
400 aa  247  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.85 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.24 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  42.89 
 
 
408 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 
407 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.11 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.1 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43 
 
 
391 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
389 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 
389 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 
389 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 
389 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.9 
 
 
445 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  39.06 
 
 
472 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
389 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.87 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.03 
 
 
424 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.7 
 
 
382 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.9 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.7 
 
 
396 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  43.07 
 
 
391 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 
413 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.6 
 
 
401 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.03 
 
 
382 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.19 
 
 
400 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.38 
 
 
397 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  44.26 
 
 
413 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  38.48 
 
 
419 aa  236  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.43 
 
 
392 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  40.18 
 
 
876 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.53 
 
 
392 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.65 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
393 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.09 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.04 
 
 
389 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.04 
 
 
389 aa  232  9e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 
392 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.62 
 
 
391 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  43.64 
 
 
399 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>