99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2187 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  63.4 
 
 
678 aa  747    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  65.81 
 
 
691 aa  808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  57.62 
 
 
731 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  59.2 
 
 
654 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  61.36 
 
 
781 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  60.44 
 
 
674 aa  698    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  72.66 
 
 
674 aa  924    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  61.73 
 
 
685 aa  772    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  99.7 
 
 
664 aa  1335    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  59.66 
 
 
678 aa  721    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  85.69 
 
 
664 aa  1138    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  100 
 
 
664 aa  1336    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  63.32 
 
 
677 aa  716    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  84.49 
 
 
664 aa  1097    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  65.2 
 
 
696 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  58.9 
 
 
658 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  78.08 
 
 
657 aa  1008    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  67.7 
 
 
682 aa  866    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  99.7 
 
 
664 aa  1335    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  73.26 
 
 
672 aa  963    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  64.86 
 
 
683 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  62.99 
 
 
668 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  63.87 
 
 
672 aa  817    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  61.56 
 
 
681 aa  754    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  64.42 
 
 
667 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  60.75 
 
 
667 aa  725    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  63.92 
 
 
704 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  59.23 
 
 
677 aa  739    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  63.82 
 
 
655 aa  826    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 
614 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  44.41 
 
 
614 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  41.77 
 
 
627 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  43.32 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  39.03 
 
 
693 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  40.85 
 
 
611 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  40.75 
 
 
672 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  36.68 
 
 
609 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  39.53 
 
 
612 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  37.4 
 
 
608 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  37 
 
 
608 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  36.84 
 
 
608 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  38.35 
 
 
611 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  35.83 
 
 
609 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  35.83 
 
 
609 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.25 
 
 
627 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  35.57 
 
 
629 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  38.1 
 
 
750 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 
653 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  35.23 
 
 
629 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  37.03 
 
 
608 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  36.38 
 
 
608 aa  353  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  36.38 
 
 
608 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  36.38 
 
 
608 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  38.27 
 
 
585 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  36.38 
 
 
608 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  36.06 
 
 
608 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  36.31 
 
 
636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  34.65 
 
 
614 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  35.43 
 
 
615 aa  337  5.999999999999999e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  37.23 
 
 
614 aa  333  7.000000000000001e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.43 
 
 
774 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  35.62 
 
 
612 aa  324  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  34.94 
 
 
615 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.47 
 
 
622 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  38.02 
 
 
650 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.23 
 
 
815 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.3 
 
 
777 aa  289  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.13 
 
 
647 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  40.38 
 
 
365 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.19 
 
 
619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 
470 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  32.16 
 
 
713 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 
713 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.89 
 
 
657 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
657 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.68 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  27.4 
 
 
685 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  28.53 
 
 
680 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  28.33 
 
 
680 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.28 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.28 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  37.39 
 
 
253 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  33.21 
 
 
272 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 
657 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  32.25 
 
 
657 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 
655 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  38.89 
 
 
101 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  25.46 
 
 
676 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  24.15 
 
 
619 aa  52  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  26.91 
 
 
755 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  23.26 
 
 
648 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 
455 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  24.67 
 
 
746 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  34.59 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  34.59 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  34.59 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.6 
 
 
449 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.6 
 
 
449 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>