More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1933 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  99.41 
 
 		 1195 aa  2327    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  59.77 
 
 		 1194 aa  1243    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  56.33 
 
 		 1214 aa  1077    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  51.79 
 
 		 1191 aa  944    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.33 
 
 		 1186 aa  947    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1172 aa  666    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  38.09 
 
 		 1225 aa  694    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  54.41 
 
 		 1183 aa  986    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  65.35 
 
 		 1194 aa  1372    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.03 
 
 		 1191 aa  1069    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  49.34 
 
 		 1213 aa  890    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.27 
 
 		 1217 aa  905    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.16 
 
 		 1188 aa  932    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1195 aa  2345    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  51.65 
 
 		 1203 aa  938    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  56.11 
 
 		 1198 aa  1095    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  59.38 
 
 		 1199 aa  1205    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  49.68 
 
 		 1222 aa  908    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  51.42 
 
 		 1181 aa  904    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  83.95 
 
 		 1194 aa  1790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  83.93 
 
 		 1194 aa  1774    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  56.2 
 
 		 1198 aa  1093    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1191 aa  941    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.54 
 
 		 1195 aa  965    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52 
 
 		 1224 aa  1050    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  99.41 
 
 		 1195 aa  2327    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  66.06 
 
 		 1217 aa  1381    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.12 
 
 		 1222 aa  943    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  75.36 
 
 		 1205 aa  1607    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.96 
 
 		 1188 aa  950    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  52.42 
 
 		 1188 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.27 
 
 		 1190 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  52.83 
 
 		 1227 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1187 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 		 1190 aa  486  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 		 1176 aa  485  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.56 
 
 		 1176 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 		 1185 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1185 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.5 
 
 		 1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1196 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 		 1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.46 
 
 		 1175 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.66 
 
 		 1174 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1177 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.52 
 
 		 1173 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.38 
 
 		 1191 aa  436  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  69.03 
 
 		 1234 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.51 
 
 		 1187 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  64.24 
 
 		 1218 aa  426  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.74 
 
 		 1148 aa  418  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.58 
 
 		 1184 aa  405  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 		 1186 aa  403  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 		 1185 aa  403  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.76 
 
 		 1177 aa  396  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.33 
 
 		 1168 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.93 
 
 		 1169 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.41 
 
 		 1168 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1167 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  62.21 
 
 		 1263 aa  361  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1181 aa  360  7e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.98 
 
 		 1170 aa  357  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1170 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.79 
 
 		 1171 aa  353  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 		 1167 aa  348  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 		 1142 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1142 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 		 1164 aa  327  9e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.06 
 
 		 1187 aa  319  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1153 aa  311  4e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1403 aa  306  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1184 aa  303  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.99 
 
 		 1186 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 		 1187 aa  296  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  38.69 
 
 		 1179 aa  295  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1198 aa  295  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.56 
 
 		 1174 aa  294  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.89 
 
 		 1134 aa  292  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  38.68 
 
 		 1174 aa  290  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.87 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.27 
 
 		 1189 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.95 
 
 		 1179 aa  283  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 		 1301 aa  277  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1171 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 		 1179 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 		 1185 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.3 
 
 		 1189 aa  273  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 		 1188 aa  265  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 		 1188 aa  265  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  52.91 
 
 		 1185 aa  258  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.42 
 
 		 1175 aa  257  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.13 
 
 		 1178 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.96 
 
 		 1190 aa  256  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  52.47 
 
 		 1185 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.29 
 
 		 1219 aa  248  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.46 
 
 		 1172 aa  247  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1178 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  45.67 
 
 		 1081 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.56 
 
 		 1186 aa  246  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  34.57 
 
 		 1162 aa  242  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>