More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1727 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  42.65 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  50 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.5 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.09 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 87 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>