More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1404 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  98.29 
 
 		 881 aa  1670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 		 894 aa  690    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  98.29 
 
 		 881 aa  1670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 876 aa  1701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  57.21 
 
 		 683 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  53.13 
 
 		 893 aa  810    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 910 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 		 927 aa  311  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 959 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  75 
 
 		 189 aa  279  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 1000 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 953 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  31.21 
 
 		 919 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  28.42 
 
 		 927 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  27.96 
 
 		 922 aa  101  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  28.03 
 
 		 913 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 913 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 938 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.28 
 
 		 977 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 928 aa  94.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 940 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.55 
 
 		 928 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.29 
 
 		 923 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 998 aa  91.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 937 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.3 
 
 		 937 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  27.81 
 
 		 930 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  38.3 
 
 		 937 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 905 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 918 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.56 
 
 		 894 aa  87.8  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 903 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  26.78 
 
 		 917 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.44 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.64 
 
 		 884 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 919 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  33.5 
 
 		 919 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 		 947 aa  82.4  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 879 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.84 
 
 		 928 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.5 
 
 		 919 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.67 
 
 		 929 aa  81.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.75 
 
 		 921 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 932 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 921 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.75 
 
 		 921 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 911 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 925 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  33.5 
 
 		 929 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  31.84 
 
 		 943 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 927 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 995 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.99 
 
 		 919 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 936 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 877 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.34 
 
 		 913 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  42.74 
 
 		 892 aa  75.5  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 951 aa  74.7  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 946 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 835 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 920 aa  73.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 918 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 929 aa  72  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  27.08 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 882 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  26.57 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 		 900 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 943 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 946 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 953 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 923 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 908 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.67 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  34.18 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 950 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  55 
 
 		 1085 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 1085 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 909 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.68 
 
 		 981 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 970 aa  66.6  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.66 
 
 		 897 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.86 
 
 		 916 aa  65.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  33.7 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 		 907 aa  64.3  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>