More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1137 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  100 
 
 
116 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
73 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
73 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
73 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
73 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3674  translation initiation factor IF-1  97.26 
 
 
111 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  98.63 
 
 
73 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  98.63 
 
 
73 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  97.26 
 
 
73 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6588  translation initiation factor IF-1  97.26 
 
 
73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  94.52 
 
 
73 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  94.52 
 
 
73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  91.78 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0605  translation initiation factor IF-1  93.15 
 
 
73 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6026  translation initiation factor IF-1  93.15 
 
 
73 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  91.78 
 
 
73 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1212  translation initiation factor IF-1  91.78 
 
 
73 aa  140  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  91.78 
 
 
73 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  91.78 
 
 
73 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  90.41 
 
 
73 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  90.41 
 
 
73 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 
73 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 
73 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  89.04 
 
 
73 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 
73 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 
73 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  86.3 
 
 
73 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 
73 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 
73 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 
73 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 
73 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  86.3 
 
 
73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 
73 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 
73 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  87.67 
 
 
73 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16940  translation initiation factor 1  83.56 
 
 
76 aa  124  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 
72 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  80.82 
 
 
85 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 
72 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
72 aa  121  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 
75 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 
73 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
72 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  78.08 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
72 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 
73 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
72 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  75.34 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 
72 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  77.03 
 
 
74 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
72 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  76.71 
 
 
73 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  73.97 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 
72 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 
74 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>