More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1104 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
566 aa  1110    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 
568 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
566 aa  1110    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 
568 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  67.44 
 
 
559 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  62.91 
 
 
578 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
566 aa  1110    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 
568 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  65.9 
 
 
575 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  63.92 
 
 
573 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 
595 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
566 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  43.88 
 
 
572 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
567 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.24 
 
 
573 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 
573 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
568 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
571 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  41.55 
 
 
591 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.02 
 
 
566 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
568 aa  359  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  41.39 
 
 
577 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  41.15 
 
 
549 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
588 aa  336  9e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
565 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
592 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
543 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  40.72 
 
 
536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
556 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  38.71 
 
 
543 aa  297  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
579 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
544 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
535 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  34.32 
 
 
635 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
525 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
590 aa  216  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
571 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  52.46 
 
 
392 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 
381 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
456 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  33.5 
 
 
391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.28 
 
 
828 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.53 
 
 
851 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
386 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
409 aa  128  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  41.18 
 
 
373 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  29.76 
 
 
385 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.92 
 
 
401 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
393 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
373 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
665 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
673 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  31.19 
 
 
484 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 
535 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  27.8 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.02 
 
 
603 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  27.8 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  27.01 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  30.04 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  25.83 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.57 
 
 
597 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  26.92 
 
 
372 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  26.22 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  29.1 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
682 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  23.57 
 
 
523 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 
523 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
725 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  33.5 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  32.86 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1510  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.88 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  35.79 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
344 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30.04 
 
 
552 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.39 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>