134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0990 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.22 
 
 
255 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.22 
 
 
255 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.96 
 
 
269 aa  328  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.95 
 
 
257 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.72 
 
 
260 aa  251  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.88 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.03 
 
 
259 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.74 
 
 
259 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.73 
 
 
329 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.23 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.02 
 
 
276 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.81 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.25 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.32 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.23 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  35.5 
 
 
316 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 
808 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 
837 aa  62  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.36 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  27.19 
 
 
286 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.26 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.81 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  28.42 
 
 
338 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.42 
 
 
338 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  29.39 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.24 
 
 
617 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  29.39 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.42 
 
 
1153 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.42 
 
 
591 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.14 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.16 
 
 
287 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.94 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  26.78 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 
634 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
639 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.95 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 
288 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  27.88 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.76 
 
 
639 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.83 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.61 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
576 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.7 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
300 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>