More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0901 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  75.61 
 
 		 133 aa  184  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  58.62 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  63.71 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  51.69 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  54.31 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  52.54 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  52.07 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  48.36 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  51.16 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  49.57 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  70.31 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  53.72 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.09 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.71 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 342 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  41.46 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.07 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  40.66 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  43.21 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  43.42 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  44.26 
 
 		 336 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 252 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.62 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  33.73 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  38.03 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>