More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0559 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  83.25 
 
 		 197 aa  339  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  82.74 
 
 		 197 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  81.73 
 
 		 197 aa  333  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  67.01 
 
 		 198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  71.21 
 
 		 200 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  67.35 
 
 		 195 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  67.55 
 
 		 183 aa  255  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  63.96 
 
 		 190 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  53.81 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  55.33 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  51.85 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  49.51 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  47.21 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  53.66 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  45.03 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  46.93 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  50.92 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  47.92 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  49.13 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.93 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  46.45 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  45.56 
 
 		 180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  46.96 
 
 		 167 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  53.11 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  49.43 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  47.46 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.39 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  49.72 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  43.37 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  49.43 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.45 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  49.38 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  48.26 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  46.07 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.5 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  50 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  45.41 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  45 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  47.4 
 
 		 185 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40.5 
 
 		 186 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  47.37 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.02 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.18 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.95 
 
 		 164 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.51 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  41.36 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.52 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  42.22 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  40.44 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.43 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  46.98 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  41.9 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  38.74 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  41.18 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  46.88 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.79 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  38.55 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  44.44 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  39.5 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.26 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.72 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.12 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.13 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.33 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.46 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.8 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.13 
 
 		 147 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.46 
 
 		 168 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.64 
 
 		 177 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.46 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.64 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.27 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  36.81 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.79 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.47 
 
 		 167 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  34.88 
 
 		 153 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  36.52 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.65 
 
 		 157 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>