More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0488 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  99.56 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  99.56 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  78.57 
 
 		 227 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  56.89 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.47 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50.44 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.45 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 		 233 aa  207  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.82 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 243 aa  204  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  42.79 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  45.98 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  48.46 
 
 		 332 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  48.67 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  47.35 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  48.21 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  49.12 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  43.05 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.38 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 270 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.77 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 244 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.81 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 277 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1225  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 		 276 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  36.54 
 
 		 304 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 300 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 317 aa  99  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  33.86 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.15 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  31.72 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 284 aa  95.5  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 273 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 		 282 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.83 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.24 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.78 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>