More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0314 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  78.89 
 
 
439 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  100 
 
 
457 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  99.78 
 
 
457 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  99.78 
 
 
457 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  83.68 
 
 
430 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  51.67 
 
 
443 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  48.76 
 
 
482 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.98 
 
 
437 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  45.24 
 
 
433 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
440 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.71 
 
 
450 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 
461 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.26 
 
 
468 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.45 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  45.28 
 
 
442 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
442 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41.72 
 
 
443 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  42.06 
 
 
460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.73 
 
 
461 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  43.68 
 
 
438 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 
446 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.3 
 
 
461 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.3 
 
 
461 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.3 
 
 
461 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.78 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.31 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.31 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.31 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.81 
 
 
430 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.63 
 
 
439 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.48 
 
 
442 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.94 
 
 
439 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.55 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.39 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  39.58 
 
 
453 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.33 
 
 
441 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42.6 
 
 
441 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.95 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.47 
 
 
436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.57 
 
 
437 aa  309  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  39.27 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.47 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  39.61 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  41.63 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.26 
 
 
439 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.46 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.07 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  38.67 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  39.5 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  38.67 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.09 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  38.67 
 
 
438 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.37 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  38.84 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.84 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  38.84 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.56 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
432 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43.42 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.76 
 
 
439 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.76 
 
 
439 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40 
 
 
439 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.76 
 
 
439 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
438 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.86 
 
 
430 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.47 
 
 
446 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.96 
 
 
432 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.11 
 
 
451 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.96 
 
 
432 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 
432 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  38.5 
 
 
458 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.62 
 
 
437 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 
444 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  40.59 
 
 
435 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.34 
 
 
439 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40 
 
 
455 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.66 
 
 
459 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.34 
 
 
439 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  38.13 
 
 
463 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.19 
 
 
439 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  38.78 
 
 
484 aa  296  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  38.5 
 
 
459 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.45 
 
 
438 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.74 
 
 
442 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.39 
 
 
445 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
466 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
448 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  38.73 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  36.69 
 
 
465 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.27 
 
 
465 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  40.72 
 
 
456 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  40.28 
 
 
460 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.9 
 
 
437 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  40.24 
 
 
445 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.58 
 
 
444 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  42.4 
 
 
452 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>